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目前,我國(guó)開設(shè)工科專業(yè)的本科高校有1003所,占本科高校總數(shù)的90%;高等工程教育的本科在校生達(dá)到371萬(wàn)人,研究生47萬(wàn)人[2]。但是,我國(guó)工程教育仍存在不少問題,主要體現(xiàn)在:人才培養(yǎng)模式單一,多樣性和適用性欠缺;工程性缺失和實(shí)踐教學(xué)薄弱問題長(zhǎng)期未得到解決;評(píng)價(jià)體系導(dǎo)向重論文、輕設(shè)計(jì)、缺實(shí)踐;對(duì)學(xué)生的創(chuàng)新教育和創(chuàng)業(yè)訓(xùn)練重視與投入不足;產(chǎn)學(xué)研合作不到位,企業(yè)不重視人才培養(yǎng)全過程的參與[3]。工科創(chuàng)新人才培養(yǎng)需要產(chǎn)學(xué)研合作教育。當(dāng)前,我國(guó)工科大學(xué)生創(chuàng)新實(shí)踐能力從總體上看顯得比較低,表現(xiàn)在有些學(xué)生缺乏創(chuàng)新實(shí)踐的理念和愿望,缺少創(chuàng)新實(shí)踐能力的毅力與意志;有些學(xué)生有創(chuàng)新實(shí)踐意識(shí)但不能很好利用,有創(chuàng)新實(shí)踐熱情但創(chuàng)新實(shí)踐能力不夠;有些學(xué)生雖有創(chuàng)新實(shí)踐靈感但缺乏創(chuàng)新實(shí)踐技能等。每年畢業(yè)生招聘會(huì)上反饋的信息表明,有些畢業(yè)生專業(yè)技能、創(chuàng)新能力和實(shí)踐能力等與用人單位的要求還存在不少差距,企業(yè)很難招收到需要的高素質(zhì)人才來承擔(dān)企業(yè)繼續(xù)發(fā)展的重任,出現(xiàn)了學(xué)生“就業(yè)難”和企業(yè)“人才荒”的兩難境地。工科院校應(yīng)正視現(xiàn)狀、分析原因,從教育理念、課程體系、教師素質(zhì)、實(shí)踐教育、課外科技實(shí)踐、社會(huì)實(shí)踐等多方面入手,構(gòu)建有利于工科大學(xué)生創(chuàng)新實(shí)踐能力的培養(yǎng)模式[4]。生物醫(yī)學(xué)工程是一門實(shí)踐性很強(qiáng)的學(xué)科,動(dòng)手與創(chuàng)新能力的培養(yǎng)對(duì)生物醫(yī)學(xué)工程專業(yè)人才培養(yǎng)來說顯得尤為重要。而生物醫(yī)學(xué)工程專業(yè)雖然已成長(zhǎng)和發(fā)展了幾十年,但是,由于其本身“新興學(xué)科”與“交叉學(xué)科”的特點(diǎn),并隨著科學(xué)技術(shù)的進(jìn)步與發(fā)展,對(duì)生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)科的認(rèn)識(shí)及基本定義都還在不斷地創(chuàng)新、調(diào)整、補(bǔ)充和完善,特別是社會(huì)上對(duì)這個(gè)專業(yè)的認(rèn)識(shí)和接受程度還不高,不大清楚這個(gè)學(xué)科的性質(zhì)、作用和地位,相關(guān)的產(chǎn)業(yè)部門認(rèn)識(shí)也較模糊。高等教育人才的培養(yǎng),不僅要適應(yīng)科學(xué)的進(jìn)步,更要滿足社會(huì)對(duì)人才的需求。當(dāng)前,數(shù)字化醫(yī)療技術(shù)正在蓬勃發(fā)展中,相關(guān)的醫(yī)療器械、醫(yī)療技術(shù)服務(wù)產(chǎn)業(yè)也在迅速壯大。珠江三角洲、長(zhǎng)江三角洲及京津環(huán)渤海灣三大區(qū)域已成為本土三大醫(yī)療器械產(chǎn)業(yè)聚集區(qū)。據(jù)不完全統(tǒng)計(jì),三大區(qū)域醫(yī)療器械總產(chǎn)值之和及其銷售額之和均占全國(guó)總量的80%以上。因此,如何結(jié)合學(xué)科的創(chuàng)新與發(fā)展,充分利用產(chǎn)業(yè)成長(zhǎng)及壯大的時(shí)機(jī),培養(yǎng)滿足社會(huì)需求的人才,是擺在生物醫(yī)學(xué)工程教育者面前的當(dāng)務(wù)之急[5]。為了提高本科生的實(shí)踐和創(chuàng)新能力,在生物醫(yī)學(xué)工程專業(yè)中,實(shí)踐教學(xué)在培養(yǎng)學(xué)生的動(dòng)手能力和創(chuàng)新能力方面是十分重要的,具有不可替代的作用。工程實(shí)踐能力與創(chuàng)新能力更是教學(xué)改革的核心目標(biāo)。工程實(shí)踐能力和創(chuàng)新能力是知識(shí)經(jīng)濟(jì)社會(huì)對(duì)優(yōu)秀工程技術(shù)人員素質(zhì)的要求,是現(xiàn)代企業(yè)應(yīng)對(duì)全球經(jīng)濟(jì)一體化、參與國(guó)際競(jìng)爭(zhēng)的需要,也是企業(yè)可持續(xù)發(fā)展的需要,同時(shí)也是建設(shè)創(chuàng)新型國(guó)家與科教興國(guó)發(fā)展戰(zhàn)略的需要。實(shí)踐是實(shí)現(xiàn)、發(fā)展、創(chuàng)新知識(shí)的源泉,是檢驗(yàn)真知的標(biāo)準(zhǔn),也是深刻認(rèn)識(shí)、理解、學(xué)習(xí)知識(shí)和技術(shù)的最好課堂與老師。人們根據(jù)經(jīng)驗(yàn)總結(jié)出一句格言:聽到的會(huì)忘掉,看到的能記住,只有親自做過的才會(huì)真正明白,并深深地刻在記憶中。只有親歷親為,才能深刻理解、掌握、運(yùn)用事物的本質(zhì)、原理、規(guī)律,并有新的發(fā)現(xiàn)和發(fā)展。過去高等學(xué)校培養(yǎng)的畢業(yè)生雖然掌握了一定的知識(shí)和技術(shù),但與企業(yè)工程師相比,他們?cè)诰C合素質(zhì)、實(shí)踐與創(chuàng)新能力方面存在著很大的差距。經(jīng)驗(yàn)告訴我們:知識(shí)≠能力,兩者之間有一個(gè)傳動(dòng)的鏈條叫做實(shí)踐,即應(yīng)用知識(shí)解決工程問題。因此要培養(yǎng)未來的卓越工程師,提高工程師教育質(zhì)量,充分開發(fā)學(xué)生的實(shí)踐與創(chuàng)新能力就必須要按照其成長(zhǎng)的特點(diǎn)和規(guī)律改革教育體系和教學(xué)模式,讓工程師教育回歸工程。
2引進(jìn)荷蘭特色化教學(xué)模式DCL培養(yǎng)生物醫(yī)學(xué)工程專業(yè)學(xué)生實(shí)踐與創(chuàng)新能力
東北大學(xué)中荷生物醫(yī)學(xué)與信息工程學(xué)院在對(duì)生物醫(yī)學(xué)工程專業(yè)實(shí)施國(guó)際化教學(xué)的過程中,結(jié)合教學(xué)實(shí)踐,以培養(yǎng)滿足社會(huì)需求的、“用得上、留得住、干得好”的實(shí)用創(chuàng)新型生物醫(yī)學(xué)工程專業(yè)人才為目標(biāo),從培養(yǎng)模式、專業(yè)課程設(shè)置、實(shí)踐教學(xué)、本科生導(dǎo)師制等多個(gè)方面,深入開展了教學(xué)改革與嘗試,并成功探索出“以項(xiàng)目為中心的課程設(shè)計(jì)”本土化實(shí)踐教學(xué)方法,取得了較好的效果。“以項(xiàng)目為中心的課程設(shè)計(jì)”是一種開展“學(xué)習(xí)+研究”的教學(xué)模式,引進(jìn)了合作方荷蘭埃因霍溫科技大學(xué)DesignCenteredLearning(DCL)教學(xué)模式,基于問題進(jìn)行研究、面向?qū)嵺`探索學(xué)習(xí),在教學(xué)中研究、在研究中教學(xué),把學(xué)生的科技能力培訓(xùn)列入教學(xué)計(jì)劃,校企合作,發(fā)揮資源優(yōu)勢(shì)。它是以學(xué)生為主體、教師為主導(dǎo),以學(xué)為中心,采取學(xué)生分組合作、查閱資料、調(diào)查研究、討論、交流等方式學(xué)習(xí)設(shè)計(jì)方法的課程。以培養(yǎng)能力為宗旨,以項(xiàng)目為載體,基于問題研究,以課題研究和問題解決為核心,學(xué)思結(jié)合、知行合一的教學(xué)活動(dòng),注重方案設(shè)計(jì)、過程訓(xùn)練,激發(fā)學(xué)生科學(xué)研究興趣,培養(yǎng)學(xué)生自主學(xué)習(xí)能力、團(tuán)隊(duì)協(xié)作能力,以及提出問題、分析問題、解決問題的能力,讓學(xué)生提前了解企業(yè)運(yùn)作機(jī)制,為學(xué)生就業(yè)乃至創(chuàng)業(yè)搭建一個(gè)良好的平臺(tái)。
3DCL在研究中教學(xué),在教學(xué)中研究——以“老年人摔倒測(cè)試”案例教學(xué)過程為例
3.1案例的選擇和設(shè)計(jì)——整合各類知識(shí)、解決實(shí)際問題
“老年人摔倒檢測(cè)”是本科生第6學(xué)期進(jìn)行的DCL項(xiàng)目。這個(gè)案例針對(duì)當(dāng)今老齡化社會(huì)的熱點(diǎn)問題——獨(dú)居老人的健康智能監(jiān)護(hù),在生物醫(yī)學(xué)工程專業(yè)領(lǐng)域是非常有實(shí)際意義和研究?jī)r(jià)值的課題。當(dāng)今獨(dú)居老人逐年增多,老人的健康問題已經(jīng)成為一個(gè)社會(huì)問題。摔倒是威脅老年人健康的一個(gè)惡性殺手。如何利用生物醫(yī)學(xué)工程的專業(yè)知識(shí),研發(fā)可以對(duì)老年人行為動(dòng)作進(jìn)行實(shí)時(shí)監(jiān)控的儀器設(shè)備,設(shè)計(jì)有效的摔倒檢測(cè)的算法,能夠在老人發(fā)生摔倒危險(xiǎn)的第一時(shí)間,通知家屬和社區(qū)醫(yī)院,從而最大程度的減輕傷害,正是這個(gè)課題需要解決的關(guān)鍵問題。而這個(gè)課題也是在學(xué)生已經(jīng)學(xué)習(xí)了信號(hào)與系統(tǒng)和數(shù)字信號(hào)處理兩門前序課程的基礎(chǔ)上展開的,讓學(xué)生們能夠直接理論聯(lián)系實(shí)際,學(xué)以致用,對(duì)知識(shí)有更加感性的認(rèn)識(shí)??傊?,從案例的選擇和設(shè)計(jì)上,首先變以教為主為以學(xué)習(xí)研究為主[6]。教師根據(jù)教學(xué)和科研經(jīng)驗(yàn),提煉出能夠涵蓋本課程主要知識(shí)內(nèi)容的項(xiàng)目或研究設(shè)計(jì)課題。選擇提煉項(xiàng)目的原則是項(xiàng)目知識(shí)化、知識(shí)問題化、問題層次化。然后成立由中外教師和企業(yè)專家組成的教學(xué)小組,編寫該案例的教案、提煉項(xiàng)目、講授工程案例,選擇可以引導(dǎo)學(xué)生對(duì)此項(xiàng)目和問題開展自主學(xué)習(xí)、合作探索研究的問題作為主要教學(xué)任務(wù)和目標(biāo)。
3.2案例進(jìn)行過程中——提高團(tuán)隊(duì)協(xié)作精神、自主學(xué)習(xí)能力
教師通過案例描述的形式提供給學(xué)生信息,通常是這樣的描述:介紹一些簡(jiǎn)單的關(guān)鍵詞、主要目標(biāo)(可以是簡(jiǎn)單的建議),并給出案例方面的一些暗示。學(xué)生需要在小組里(最多不超過8人)完成這個(gè)案例。為此,他們需要在助教的協(xié)助下每周進(jìn)行一次會(huì)議,每個(gè)案例持續(xù)10周。與傳統(tǒng)課程不同的是助教的職責(zé)是作為一名觀察者為學(xué)生提供改善方案的建議,而不是傳統(tǒng)意義上單純地傳授知識(shí)。在每次會(huì)議期間,學(xué)生需要確認(rèn)自己欠缺的知識(shí)、明確自學(xué)作業(yè)中自己需要完成的任務(wù)。每個(gè)學(xué)生都需要做這些任務(wù)并且需要在下次會(huì)議中向整個(gè)小組匯報(bào)自己做的結(jié)果。除了專業(yè)知識(shí)部分的任務(wù),學(xué)生還會(huì)討論到各自的進(jìn)步,如由于在小組里擔(dān)任討論組長(zhǎng)、會(huì)議記錄秘書和板書等角色而學(xué)會(huì)的相應(yīng)技巧。總的來說,DCL主要是鼓勵(lì)學(xué)生自主學(xué)習(xí),鼓勵(lì)組員之間進(jìn)行團(tuán)隊(duì)合作,鼓勵(lì)學(xué)生獨(dú)立思考如何組建實(shí)驗(yàn)、如何做報(bào)告、如何開展一次有效的會(huì)議以及如何成為領(lǐng)導(dǎo)者[7]。
3.3案例完成效果考核方式——顛覆死記硬背的傳統(tǒng)方式、改善被動(dòng)抄襲的學(xué)習(xí)態(tài)度
教學(xué)模式、目標(biāo)改變了,成績(jī)考核方式也改變了——小組、教師評(píng)價(jià)學(xué)習(xí)研究成果。因此評(píng)價(jià)學(xué)生的學(xué)習(xí)研究成果時(shí)要用新的方法來評(píng)價(jià)。要從學(xué)習(xí)知識(shí)轉(zhuǎn)向?qū)W習(xí)能力轉(zhuǎn)變,從關(guān)注結(jié)果向過程與結(jié)果并重轉(zhuǎn)變。要重點(diǎn)考核自學(xué)能力、研究能力、實(shí)踐能力、創(chuàng)新能力、學(xué)習(xí)研究的態(tài)度和學(xué)習(xí)研究的成果。小組和教師要結(jié)合個(gè)人在項(xiàng)目中完成任務(wù)的情況、工作量的大小、難易程度、貢獻(xiàn)大小、自主學(xué)習(xí)與研究的態(tài)度、創(chuàng)新等情況給出該門課程的成績(jī)。值得注意的是教學(xué)觀念轉(zhuǎn)變的體現(xiàn)標(biāo)準(zhǔn)是:只要經(jīng)過學(xué)習(xí)和研究學(xué)會(huì)了知識(shí),收獲了能力,不看成果和貢獻(xiàn)大小,都在合格以上??己嗽u(píng)價(jià)方法的改革,就是要解放學(xué)生,讓其輕松快樂地學(xué)習(xí),使學(xué)習(xí)成為一種有趣的研究活動(dòng)。就“老年人摔倒檢測(cè)”這個(gè)案例來說,最終的考核結(jié)果來源于多個(gè)方面,包括指導(dǎo)教師根據(jù)平時(shí)學(xué)生的表現(xiàn)、每周的自學(xué)報(bào)告、會(huì)議記錄、會(huì)議日程完成的情況給定的分?jǐn)?shù),小組中期答辯的分?jǐn)?shù),期末答辯時(shí)評(píng)委根據(jù)小組儀器設(shè)備展示以及PPT講述情況給定的分?jǐn)?shù),其他小組評(píng)價(jià)的分?jǐn)?shù),組員之間互評(píng)的分?jǐn)?shù)等多個(gè)方面,從不同維度對(duì)學(xué)生成績(jī)進(jìn)行評(píng)估,使考核方式脫離傳統(tǒng),更加科學(xué)合理,更有效地調(diào)動(dòng)學(xué)生們的積極性[8]。實(shí)踐表明,這門課程很受學(xué)生喜愛,“老年人摔倒檢測(cè)”這個(gè)案例也取得了比預(yù)期更好的成效。學(xué)生們普遍反映,對(duì)前序的信號(hào)與系統(tǒng)和數(shù)字信號(hào)處理的課程理論知識(shí)的理解更加深入,而對(duì)怎么分工合作完成項(xiàng)目也有了初步的了解,對(duì)未來的工作或者繼續(xù)深造都有很多益處。
4實(shí)踐效果
經(jīng)過多年的中外校企合作、學(xué)研產(chǎn)醫(yī)結(jié)合,利用教學(xué)資源和優(yōu)勢(shì),實(shí)施以項(xiàng)目為載體、基于問題的研究,學(xué)研一體,在研究中教學(xué),在教學(xué)中研究的DCL教學(xué)改革,使教學(xué)得到了真正意義上的回歸,變以教為中心為以學(xué)為中心,學(xué)生回歸了學(xué)習(xí)的主體地位,教師變成了主導(dǎo)的角色。把學(xué)習(xí)和研究集合于項(xiàng)目之中,學(xué)習(xí)知識(shí)與收獲能力共生并進(jìn),用新的考核評(píng)價(jià)方式評(píng)價(jià)學(xué)生的學(xué)習(xí),減輕了學(xué)生的學(xué)習(xí)負(fù)擔(dān),使學(xué)習(xí)變成了一種積極快樂的研究活動(dòng)。東北大學(xué)中荷生物醫(yī)學(xué)與信息工程學(xué)院本科生大學(xué)4年中除基本實(shí)驗(yàn)實(shí)踐類課程外,主持并實(shí)際參與的項(xiàng)目案例達(dá)10余項(xiàng),共計(jì)2400余學(xué)時(shí),學(xué)生的英語(yǔ)能力、動(dòng)手能力及創(chuàng)新能力得到顯著提高。幾年來本科生的就業(yè)率達(dá)到100%。在實(shí)習(xí)與實(shí)訓(xùn)考核中,絕大多數(shù)學(xué)生被東軟集團(tuán)一類的企業(yè)納入人才儲(chǔ)備庫(kù)。這種研究型的教學(xué)模式的優(yōu)勢(shì)越來越凸顯,正在改變著教學(xué)的水平和質(zhì)量,也在改變著教師的教學(xué)觀念,同時(shí)也改變著學(xué)生的學(xué)習(xí)觀。
5結(jié)語(yǔ)
關(guān)鍵詞:大數(shù)據(jù);海量存儲(chǔ);數(shù)據(jù)挖掘;標(biāo)本庫(kù);醫(yī)學(xué)生物信息;數(shù)據(jù)挖掘
隨著信息技術(shù)在醫(yī)學(xué)臨床和科研中的應(yīng)用,臨床醫(yī)學(xué)、生物學(xué)、信息學(xué)發(fā)生了一次交叉融合, 這種以生物大數(shù)據(jù)信息是未來生物醫(yī)學(xué)研究發(fā)展的核心點(diǎn)。這種以海量、高維度、數(shù)據(jù)變量復(fù)雜、為特征的數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu), 需要我們?cè)趥鹘y(tǒng)的醫(yī)學(xué)基礎(chǔ)之上集數(shù)學(xué)、統(tǒng)計(jì)學(xué)、工程學(xué)、計(jì)算機(jī)信息科學(xué)的交叉綜合、理論和實(shí)驗(yàn)相結(jié)合,建立新的新方法和手段。使得我們的臨床醫(yī)學(xué)模式從經(jīng)驗(yàn)醫(yī)學(xué)進(jìn)一步向循證醫(yī)學(xué)轉(zhuǎn)變,無序醫(yī)療向著有序醫(yī)療發(fā)展,醫(yī)學(xué)研究也會(huì)進(jìn)入從發(fā)現(xiàn)、研究、驗(yàn)證、應(yīng)用到再發(fā)現(xiàn)、再研究、再驗(yàn)證、再應(yīng)用的迭代式良性循環(huán)過程中。
1實(shí)現(xiàn)大數(shù)據(jù)的大價(jià)值是醫(yī)學(xué)信息建設(shè)的新目標(biāo)
信息化時(shí)代各行業(yè)信息數(shù)據(jù)量呈現(xiàn)指數(shù)上升,醫(yī)療行業(yè)的數(shù)據(jù)信息增長(zhǎng)更快。經(jīng)研究表明,未來10年醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)將高爆式地增長(zhǎng),其增長(zhǎng)來源于醫(yī)院醫(yī)療信息運(yùn)行數(shù)據(jù)的積累、新的臨床信息系統(tǒng)的嵌入(如電子病例系統(tǒng))、新醫(yī)療診療設(shè)備接入等。隨著醫(yī)學(xué)的進(jìn)步以生物芯片為代表的高通量生物技術(shù)的飛速發(fā)展,基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、代謝組學(xué)的信息也會(huì)涌入醫(yī)學(xué)生物信息領(lǐng)域。這種大量高速增長(zhǎng)的數(shù)據(jù)被稱之為海量數(shù)據(jù)或者大數(shù)據(jù)(big data)。大數(shù)據(jù)的特點(diǎn)是海量、高維度、數(shù)據(jù)變量復(fù)雜、分析處理復(fù)雜。
隨著信息技術(shù)在醫(yī)學(xué)臨床和科研中的應(yīng)用,臨床醫(yī)學(xué)、生物學(xué)、信息學(xué)發(fā)生了一次交叉融合,形成了生物醫(yī)學(xué)信息學(xué)(Biomedical Informatics)。這種以生物大數(shù)據(jù)信息是未來生物醫(yī)學(xué)研究發(fā)展的核心點(diǎn)。我們可以看到,生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的大數(shù)據(jù)時(shí)代正在來臨,其發(fā)展將促使我們盡快構(gòu)建一個(gè)實(shí)時(shí)、便捷、全方位的醫(yī)學(xué)生物信息挖掘和應(yīng)用系統(tǒng)。在醫(yī)學(xué)信息研究方面,我國(guó)還主要處在對(duì)醫(yī)療流程的信息化管理、質(zhì)量控制等初級(jí)階段,尚未開展面對(duì)"大數(shù)據(jù)"挖掘的系統(tǒng)研究與應(yīng)用,但這種研究與挖掘應(yīng)用必將成為生物醫(yī)藥科學(xué)技術(shù)發(fā)展的趨勢(shì)。大數(shù)據(jù)時(shí)代的到來,既對(duì)臨床醫(yī)生、研究人員、醫(yī)院管理者、醫(yī)療監(jiān)管機(jī)構(gòu)等都提出了巨大的挑戰(zhàn),也為生物醫(yī)學(xué)研究帶來了前所未有的機(jī)遇。生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域里科學(xué)研究的一個(gè)重要發(fā)展趨勢(shì)就是數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)。以前進(jìn)行實(shí)驗(yàn)研究的目的是獲得結(jié)論或者是提出一種新的假設(shè),大數(shù)據(jù)技術(shù)通過對(duì)海量數(shù)據(jù)的研究來探索其中的規(guī)律,可以直接提出假設(shè)或得出可靠的結(jié)論。
當(dāng)前,以臨床醫(yī)療信息為基礎(chǔ)的計(jì)算機(jī)信息系統(tǒng)可擴(kuò)展到多個(gè)相聯(lián)的信息系統(tǒng),包括:電子病例系統(tǒng)、隨訪信息管理系統(tǒng)、實(shí)驗(yàn)室信息管理系統(tǒng)、生物信息分析系統(tǒng)、基因組學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)系統(tǒng)、藥物臨床試驗(yàn)信息系統(tǒng)等,在醫(yī)學(xué)科研與臨床應(yīng)用之間架起了一道不可或缺的橋梁。收集大數(shù)據(jù)、整合大數(shù)據(jù)、處理和分析大數(shù)據(jù),形成價(jià)值密度高、利用價(jià)值高的數(shù)據(jù)資源體系,實(shí)現(xiàn)"大數(shù)據(jù)"的"大價(jià)值",是醫(yī)學(xué)信息建設(shè)的新目標(biāo)。
2大數(shù)據(jù)挖掘?qū)⒈P活醫(yī)學(xué)生物信息資產(chǎn)
醫(yī)學(xué)生物信息的大數(shù)據(jù)包括醫(yī)療對(duì)象以及與醫(yī)療對(duì)象相關(guān)的信息特征集合,生物標(biāo)本以及與生物標(biāo)本信息相關(guān)的特征集合,這些大數(shù)據(jù)集帶有自己的、潛在的、未被揭示的規(guī)律趨勢(shì)特征,這才是醫(yī)學(xué)生物信息價(jià)值的核心所在。這些醫(yī)學(xué)生物信息是我們進(jìn)行用于人類健康研究?jī)r(jià)值的資產(chǎn),研究、分析、挖掘海量醫(yī)學(xué)生物信息就是盤活人類健康研究的資產(chǎn)。數(shù)據(jù)挖掘,也稱知識(shí)發(fā)現(xiàn),是盤活這些寶貴的醫(yī)學(xué)生物信息資產(chǎn)的有力工具。
大數(shù)據(jù)的挖掘和應(yīng)用不同于傳統(tǒng)的采樣分析法,它有自身的一些獨(dú)特特點(diǎn),如:①大數(shù)據(jù)挖掘分析與事物相關(guān)的所有數(shù)據(jù),而非少量數(shù)據(jù)樣本,研究的樣本數(shù)量趨近于總體數(shù)量;②大數(shù)據(jù)挖掘追求的是效率和趨勢(shì),而非絕對(duì)的準(zhǔn)確性;③大數(shù)據(jù)挖掘更多關(guān)注事物的相關(guān)關(guān)系而非因果關(guān)系,這種信息與信息之間的相關(guān)關(guān)系會(huì)提醒我們某件事情正在發(fā)生。
同時(shí),從數(shù)據(jù)中發(fā)現(xiàn)價(jià)值的實(shí)踐也由來已久。橫跨數(shù)據(jù)庫(kù)技術(shù)、統(tǒng)計(jì)學(xué)和機(jī)器學(xué)習(xí)等交叉學(xué)科和技術(shù)的數(shù)據(jù)挖掘是大數(shù)據(jù)分析的基礎(chǔ),傳統(tǒng)的數(shù)據(jù)分析實(shí)踐是無法適應(yīng)大數(shù)據(jù)的發(fā)展的。
近年來,數(shù)據(jù)挖掘引起了信息產(chǎn)業(yè)界的極大關(guān)注。其主要原因是,由業(yè)務(wù)系統(tǒng)產(chǎn)生的大量數(shù)據(jù),迫切需要將這些數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換成有用的信息和知識(shí),并廣泛使用于業(yè)務(wù)中。獲取的信息和知識(shí)可以廣泛用于各種實(shí)踐應(yīng)用,包括商務(wù)管理、生產(chǎn)控制、市場(chǎng)分析、工程設(shè)計(jì)和科學(xué)探索等領(lǐng)域。數(shù)據(jù)挖掘利用了來自如下一些領(lǐng)域的思想和方法:統(tǒng)計(jì)學(xué)、人工智能、模式識(shí)別、機(jī)器學(xué)習(xí)等。數(shù)據(jù)挖掘的很多算法都采用了以上領(lǐng)域中的理論算法、建模技術(shù)和學(xué)習(xí)理論等。數(shù)據(jù)挖掘也迅速地接納了來自其他領(lǐng)域的思想,這些領(lǐng)域包括最優(yōu)化技術(shù)、進(jìn)化計(jì)算、信息論、信號(hào)處理、可視化和信息檢索技術(shù)等。數(shù)據(jù)挖掘也需要數(shù)據(jù)庫(kù)系統(tǒng)提供有效的存儲(chǔ)、索引和查詢處理得支持。源于高性能并行計(jì)算的技術(shù)在處理海量數(shù)據(jù)集方面常常是也重要的。分布式計(jì)算技術(shù)也能有效地幫助處理海量數(shù)據(jù),并且當(dāng)數(shù)據(jù)不能集中到一起處理時(shí)更是至關(guān)重要的[2]。
醫(yī)學(xué)生物信息的數(shù)據(jù)挖掘應(yīng)用比較廣泛,醫(yī)學(xué)樣本庫(kù)領(lǐng)域的應(yīng)用就是其中的一個(gè)實(shí)例。通過建立臨床醫(yī)學(xué)樣本信息篩選和偵測(cè)交互信息平臺(tái)來建立協(xié)作樣本庫(kù)和虛擬樣本庫(kù)。建立樣本庫(kù)協(xié)作單位的協(xié)作機(jī)制、嚴(yán)格的樣本篩選策略(根據(jù)研究項(xiàng)目協(xié)議和國(guó)家地方相關(guān)標(biāo)準(zhǔn)診斷、歸轉(zhuǎn)標(biāo)準(zhǔn)[5-7])、應(yīng)答式的標(biāo)本收集機(jī)制、樣本區(qū)域內(nèi)(研究機(jī)構(gòu)、轉(zhuǎn)化中心、醫(yī)院)權(quán)利共享機(jī)制,以建立全新模式、響應(yīng)一致、反應(yīng)迅速、整齊劃一的樣本收集研究管理的體系。建設(shè)樣本從標(biāo)篩選、采集、管理策略運(yùn)轉(zhuǎn)的實(shí)例,是以一個(gè)研究中心結(jié)合4~5個(gè)醫(yī)院以及4~5個(gè)樣本篩選醫(yī)院,建立研究臨床醫(yī)學(xué)轉(zhuǎn)化知識(shí)發(fā)現(xiàn)和研究驗(yàn)證系統(tǒng)信息平臺(tái)和建立臨床醫(yī)學(xué)樣本信息篩選和偵測(cè)交互信息平臺(tái)的基礎(chǔ)。
醫(yī)學(xué)生物信息的數(shù)據(jù)挖掘應(yīng)用的另一個(gè)實(shí)例是醫(yī)學(xué)科研。生物醫(yī)藥領(lǐng)域里科學(xué)研究的一個(gè)重要發(fā)展趨勢(shì)就是數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)。以前進(jìn)行實(shí)驗(yàn)研究的目的是獲得結(jié)論或者是提出一種新的假設(shè),而現(xiàn)在通過對(duì)海量數(shù)據(jù)的研究來探索其中的規(guī)律,可以直接提出假設(shè)或得出可靠的結(jié)論[8]。另一方面,必須清楚的是,大數(shù)據(jù)作用與價(jià)值的重點(diǎn)在于能夠引導(dǎo)和啟發(fā)科研者的創(chuàng)新思維、并輔助決策。簡(jiǎn)單而言,若是處理一個(gè)問題,通常人能夠想到一種方法,而大數(shù)據(jù)能夠提供若干種參考方法,將解決問題的思路拓寬、拓廣、拓深。當(dāng)然我們需要在學(xué)科知識(shí)的結(jié)合上下內(nèi)功,不能單純依靠智能挖掘技術(shù)及工具就能解決大數(shù)據(jù)的應(yīng)用問題,實(shí)際上我們還要有熟悉掌握和運(yùn)用智能挖掘技術(shù)及工具的業(yè)務(wù)技術(shù)人才,才能在浩瀚的信息資源中遨游,才能真正利用好醫(yī)學(xué)信息這個(gè)巨大的資產(chǎn)。
3挖掘和利用醫(yī)學(xué)生物信息的技術(shù)方法
醫(yī)學(xué)科學(xué)的第三次革命需要在傳統(tǒng)的醫(yī)學(xué)基礎(chǔ)之上集數(shù)學(xué)、統(tǒng)計(jì)學(xué)、工程學(xué)、計(jì)算機(jī)信息科學(xué)的交叉綜合、理論和實(shí)驗(yàn)相結(jié)合,建立新的新方法和手段。目前,我國(guó)醫(yī)院信息系統(tǒng)存在著許多問題,集中體現(xiàn)在:醫(yī)學(xué)生物信息內(nèi)容缺失、信息標(biāo)準(zhǔn)化程度低以及發(fā)展目標(biāo)不明確等問題上。我們建設(shè)目的①堅(jiān)持醫(yī)療一線的工作需要,②堅(jiān)守醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)信息資源的理念,③做好大數(shù)據(jù)收儲(chǔ)分析的準(zhǔn)備工作。 大數(shù)據(jù)時(shí)代醫(yī)院該如何挖掘和利用醫(yī)學(xué)生物信息?我們通過與國(guó)內(nèi)外有關(guān)數(shù)據(jù)挖掘的技術(shù)專家的合作,總結(jié)了醫(yī)學(xué)生物信息的挖掘和利用的一些方法。
3.1數(shù)據(jù)集成(多種數(shù)據(jù)源可以組合在一起) 把不同來源、格式、特點(diǎn)性質(zhì)的數(shù)據(jù)在邏輯上或物理上有機(jī)地集中,從而為醫(yī)院和研究機(jī)構(gòu)提供局部的或全面的數(shù)據(jù)共享。
3.2數(shù)據(jù)選擇(從數(shù)據(jù)庫(kù)中提取與分析任務(wù)相關(guān)的數(shù)據(jù)) 根據(jù)確定的數(shù)據(jù)分析對(duì)象,抽象出在數(shù)據(jù)分析中所需要的特征信息,然后選擇合適的信息收集方法,將收集到的信息存入數(shù)據(jù)庫(kù)。對(duì)于海量數(shù)據(jù),選擇一個(gè)合適的數(shù)據(jù)存儲(chǔ)和管理的數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)是至關(guān)重要的。
3.3數(shù)據(jù)規(guī)約 數(shù)據(jù)挖掘時(shí)往往數(shù)據(jù)量非常大,在大量數(shù)據(jù)上進(jìn)行挖掘分析需要很長(zhǎng)的時(shí)間,數(shù)據(jù)歸約技術(shù)可以用來得到數(shù)據(jù)集的歸約表示,它小得多但仍然接近于保持原數(shù)據(jù)的完整性,數(shù)據(jù)挖掘的結(jié)果與歸約前結(jié)果相同或幾乎相同。
3.4數(shù)據(jù)清理(消除噪音或不一致數(shù)據(jù)) 在數(shù)據(jù)庫(kù)中的數(shù)據(jù)有一些是不完整的(有些感興趣的屬性缺少屬性值)、含噪聲的(包含錯(cuò)誤的屬性值),并且是不一致的(同樣的信息不同的表示方式),因此需要進(jìn)行數(shù)據(jù)清理,將完整、正確、一致的數(shù)據(jù)信息存入數(shù)據(jù)庫(kù)中,否則會(huì)影響數(shù)據(jù)挖掘的結(jié)果。
3.5數(shù)據(jù)變換(數(shù)據(jù)變換或統(tǒng)一成適合挖掘的形式;如,通過匯總或聚集操作等) 通過平滑聚集、數(shù)據(jù)概化、規(guī)范化等方式將數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換成適用于數(shù)據(jù)挖掘的形式。對(duì)于有些實(shí)數(shù)型數(shù)據(jù),通過概念分層和數(shù)據(jù)的離散化來轉(zhuǎn)換數(shù)據(jù)也是重要的一步。
3.6模型運(yùn)算(使用智能化的算法提取數(shù)據(jù)模式) 根據(jù)數(shù)據(jù)庫(kù)中的數(shù)據(jù)信息,選擇合適的分析工具,應(yīng)用統(tǒng)計(jì)方法、事例推理、決策樹、規(guī)則推理、模糊集、神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)、遺傳算法等方法處理信息,得出有用的分析信息。通過對(duì)數(shù)據(jù)的挖掘,①可以發(fā)現(xiàn)數(shù)據(jù)的歷史規(guī)律,對(duì)過去進(jìn)行總結(jié);②可以根據(jù)數(shù)據(jù)對(duì)未來進(jìn)行預(yù)測(cè),研究者可以根據(jù)預(yù)測(cè)對(duì)未來行情趨勢(shì)做出預(yù)判,并作出相關(guān)決策。
3.7模型評(píng)估 根據(jù)某種興趣度度量,識(shí)別提供知識(shí)的真正有趣的模式。
3.8知識(shí)表示。(使用可視化和知識(shí)表示技術(shù),向用戶提供挖掘的知識(shí)) 將數(shù)據(jù)挖掘所得到的分析信息以可視化的方式呈現(xiàn)給用戶,或作為新的知識(shí)存放在知識(shí)庫(kù)中,供其他應(yīng)用程序使用。使用各種圖表、三維地圖、動(dòng)態(tài)模擬以及相關(guān)的動(dòng)畫技術(shù)使原本枯燥乏味的數(shù)據(jù)變得生動(dòng)起來。數(shù)據(jù)可視化把數(shù)據(jù)以更加直觀的形態(tài)展現(xiàn)出來,使人們對(duì)相關(guān)數(shù)據(jù)做到一目了然。經(jīng)過上面幾步我們就把原先認(rèn)為毫無價(jià)值的數(shù)據(jù)變成了信息,最后演變?yōu)橛袃r(jià)值的知識(shí)。
對(duì)于醫(yī)學(xué)生物信息挖掘系統(tǒng)的建設(shè)者(這里包括醫(yī)院科研部門和信息部門)來說,數(shù)據(jù)挖掘項(xiàng)目不因該是一個(gè)普通的IT項(xiàng)目,不能依照原來信息項(xiàng)目模式建設(shè),更不能理解成為是個(gè)管理工具,在項(xiàng)目各個(gè)階段,數(shù)據(jù)信息每一次挖掘、演繹、分析是建設(shè)者和研究者全程參與的藝術(shù)性結(jié)合。目前對(duì)于各行業(yè)、各類典型問題的數(shù)據(jù)挖掘應(yīng)用,還缺乏標(biāo)桿模式作為參考。數(shù)據(jù)挖掘工作更像一個(gè)年輕醫(yī)師,需要通過不斷嘗試來積累經(jīng)驗(yàn),面對(duì)如潮水般涌來的海量數(shù)據(jù),她必將成為了生物醫(yī)學(xué)研究的支柱技術(shù)之一。
綜上所述,在今后的發(fā)展中計(jì)算機(jī)硬件性能的巨幅提升和數(shù)據(jù)庫(kù)技術(shù)的飛速發(fā)展,使得企業(yè)級(jí)大數(shù)據(jù)量的計(jì)算成為現(xiàn)實(shí),數(shù)據(jù)挖掘涉及的數(shù)據(jù)量會(huì)更大。數(shù)據(jù)挖掘工具也將越來越強(qiáng)大,匯合的挖掘算法越來越多,并將逐步實(shí)現(xiàn)算法的自動(dòng)選擇和參數(shù)自動(dòng)調(diào)優(yōu),數(shù)據(jù)挖掘各類算法的巨大潛力將得到充分發(fā)揮。
我們?cè)O(shè)想在不久的將來,生物信息大數(shù)據(jù)的應(yīng)用將會(huì)改變著醫(yī)學(xué)臨床實(shí)踐。臨床醫(yī)學(xué)模式從經(jīng)驗(yàn)醫(yī)學(xué)進(jìn)一步向循證醫(yī)學(xué)轉(zhuǎn)變,無序醫(yī)療向著有序醫(yī)療進(jìn)一步發(fā)展,醫(yī)學(xué)研究也會(huì)進(jìn)入從發(fā)現(xiàn)、研究、驗(yàn)證、應(yīng)用到再發(fā)現(xiàn)、再研究、再驗(yàn)證、再應(yīng)用的迭代式良性循環(huán)過程中。古老的醫(yī)學(xué)走到了今天,已經(jīng)發(fā)展成為多學(xué)科、多領(lǐng)域結(jié)合交匯的領(lǐng)域,生物信息科學(xué)、計(jì)算機(jī)科學(xué)和計(jì)算應(yīng)用數(shù)學(xué)的介入為大數(shù)據(jù)信息時(shí)代開創(chuàng)了新的前景,未來數(shù)據(jù)資源將會(huì)成為極具研究?jī)r(jià)值的醫(yī)學(xué)資產(chǎn),而且我國(guó)又是一個(gè)醫(yī)學(xué)研究資源豐富的大國(guó),我們有理由相信,我們的醫(yī)學(xué)研究者會(huì)通過醫(yī)學(xué)生物信息的挖掘和利用,在醫(yī)學(xué)的研究和發(fā)展中為廣大人民的健康事業(yè)做出更多貢獻(xiàn)。
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(一)背景及意義
二十一世紀(jì)我國(guó)將面臨人口眾多、交通擁擠、醫(yī)院容量有限,以及由于獨(dú)生子政策導(dǎo)致的日益嚴(yán)重的人口老齡化等一系列嚴(yán)重的社會(huì)問題,遠(yuǎn)程醫(yī)療技術(shù)的發(fā)展可望為我們提供一個(gè)緩解上述問題的有效途徑。最簡(jiǎn)單的遠(yuǎn)程醫(yī)療形式是通過PSTN(公共電話網(wǎng)絡(luò))進(jìn)行心電(ECGs)的遠(yuǎn)程解釋,但目前的遠(yuǎn)程醫(yī)療技術(shù)研究與試驗(yàn)則是伴隨當(dāng)前IT技術(shù)的發(fā)展而發(fā)展的一個(gè)范圍更加廣泛,意義更加深遠(yuǎn)的新興領(lǐng)域。它是現(xiàn)代通訊技術(shù)和計(jì)算機(jī)與現(xiàn)代醫(yī)學(xué)相結(jié)合的產(chǎn)物,它利用電子通訊及多媒體技術(shù)實(shí)現(xiàn)遠(yuǎn)距離醫(yī)學(xué)檢測(cè),監(jiān)護(hù),咨詢,急救,保健,診斷,治療,以及遠(yuǎn)距離教育和管理等等。遠(yuǎn)程醫(yī)療旨在通過提供一種管理良好、高效和跨越時(shí)空障礙的全新醫(yī)療保健服務(wù)模式,最終達(dá)到共享醫(yī)療保健資源,降低醫(yī)療保健費(fèi)用,提高醫(yī)療效率和質(zhì)量的目的。另外,在戰(zhàn)場(chǎng)救護(hù),交通等意外事故危重病人的緊急處理等方面,遠(yuǎn)程醫(yī)療技術(shù)也有很大的應(yīng)用價(jià)值!廣義地講,遠(yuǎn)程醫(yī)療是指醫(yī)護(hù)人員利用通訊和電子技術(shù)來跨越時(shí)空障礙、向人們提供醫(yī)療保健服務(wù)。根據(jù)不同的應(yīng)用,遠(yuǎn)程醫(yī)療又可分類為遠(yuǎn)程監(jiān)護(hù),遠(yuǎn)程治療,遠(yuǎn)程會(huì)診和遠(yuǎn)程教育等等。
(二)發(fā)展過程
最早的遠(yuǎn)程醫(yī)療雛形可以追溯到1905年Einthoven等人利用電話線進(jìn)行的心電圖數(shù)據(jù)傳輸實(shí)驗(yàn)。但真正具有一定實(shí)用價(jià)值的遠(yuǎn)程醫(yī)療系統(tǒng)在50年代才開始出現(xiàn),該系統(tǒng)可以通過電話線和專用線傳送簡(jiǎn)單的醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)。而在70~80年代遠(yuǎn)程醫(yī)療開始利用電視系統(tǒng)傳輸醫(yī)學(xué)圖像,即以遠(yuǎn)程放射醫(yī)學(xué)(Tele-radiology)為主。隨著現(xiàn)代微電子學(xué)、通訊技術(shù)、計(jì)算機(jī)及網(wǎng)絡(luò)技術(shù)的發(fā)展,在90年代人們開始實(shí)踐與評(píng)估該系統(tǒng)在遠(yuǎn)程醫(yī)療咨詢、遠(yuǎn)程教育、遠(yuǎn)程專家會(huì)診等多方面的應(yīng)用。近幾年來,隨著醫(yī)用數(shù)字影象設(shè)備如CT、MRI、B超以及DSA等的迅速普及,促使越來越多的醫(yī)院采用數(shù)字圖像存儲(chǔ)通訊系統(tǒng)(PACS,PictureArchivingandCommunicationSystem),逐步實(shí)現(xiàn)醫(yī)院的無膠片管理,為普及遠(yuǎn)程醫(yī)療奠定了良好基礎(chǔ)。當(dāng)前,遠(yuǎn)程醫(yī)療系統(tǒng)技術(shù)的技術(shù)支持有:交互視頻影像設(shè)備(interactivevideo),高分辨監(jiān)視器(high-resolutionmonitors),計(jì)算機(jī)網(wǎng)絡(luò)(computernetworks),蜂窩電話(cellulartelephones),高速開關(guān)系統(tǒng)(high-speedswitchsystems),以及以光纖和衛(wèi)星通信為核心的信息高速公路等。需要說明的是,在目前的中國(guó),由于網(wǎng)絡(luò)的普及面仍然十分有限,在一些中小縣城市,既缺少高水平的醫(yī)療專家又缺少足夠帶寬的信息網(wǎng)絡(luò),患者的經(jīng)濟(jì)能力也十分有限。在這種背景下,基于電話線的遠(yuǎn)程醫(yī)療服務(wù)在一定程度上滿足了當(dāng)前的需求,顯示出了一定的發(fā)展空間,值得國(guó)內(nèi)的醫(yī)療電子企業(yè)重視。
(三)適宜范圍和初步的臨床效果
遠(yuǎn)程醫(yī)療技術(shù)(Tele-medicine)最大的作用在于它對(duì)農(nóng)村和不發(fā)達(dá)國(guó)家的那些得不到良好服務(wù)的人群提供健康護(hù)理服務(wù)。在這些地方,合格醫(yī)生的缺乏是一個(gè)很大的問題。其他需要遠(yuǎn)程醫(yī)療的地方包括:邊遠(yuǎn)的兵站,需要保密的地方,出院后病人的監(jiān)護(hù),家庭監(jiān)護(hù),病人教育,醫(yī)學(xué)教育等。有些醫(yī)學(xué)部門,如放射學(xué)(radiology),病理學(xué)(pathology)和心臟病學(xué)(cardiology),他們需要高保真的電子醫(yī)務(wù)數(shù)據(jù)和圖像為診斷服務(wù),因而特別適合于采用遠(yuǎn)程醫(yī)療。隨著遠(yuǎn)程醫(yī)療技術(shù)的成熟,它能夠提供服務(wù)的醫(yī)學(xué)部門和范圍也會(huì)隨之相應(yīng)地增加。比如,以下這些領(lǐng)域的遠(yuǎn)程醫(yī)療實(shí)踐正在逐步增多:矯形外科學(xué)(orthopedics),皮膚病學(xué)(dermatology),精神病學(xué)(psychiatry),腫瘤學(xué)(oncology),神經(jīng)病學(xué)(neurology),兒科學(xué)(pediatrics),產(chǎn)科學(xué)(obstetrics),風(fēng)濕病學(xué)(rheumatology),血液學(xué)(hematology),耳咽喉科學(xué)(otolaryngology),眼科學(xué)(ophthalmol-ogy),泌尿科學(xué)(urology),外科(surgery)等??偟膩碚f,有關(guān)報(bào)告顯示,遠(yuǎn)程醫(yī)療提供了醫(yī)生與遠(yuǎn)端之間的可靠的高質(zhì)量的數(shù)據(jù)和音頻視頻通信。通過將遠(yuǎn)程醫(yī)療和直接的醫(yī)生診斷相比較發(fā)現(xiàn),二者沒有大的差異。這些初步的結(jié)果說明,遠(yuǎn)程醫(yī)療提供了與醫(yī)院相當(dāng)?shù)姆?wù)質(zhì)量。目前,遠(yuǎn)程醫(yī)療已被成功地用于直接的病人監(jiān)護(hù),它明顯地改進(jìn)了醫(yī)生的診斷能力和對(duì)病人的處理選擇。遠(yuǎn)程醫(yī)療在臨床醫(yī)學(xué)中的作用已被完全證實(shí),它的使用情況已經(jīng)超過了立法和行政部門的步伐。因此,在未來健康監(jiān)護(hù)工業(yè)的發(fā)展策略中,遠(yuǎn)程醫(yī)療應(yīng)是一個(gè)不可忽略的因素。一個(gè)重要的目標(biāo)是實(shí)現(xiàn)兩個(gè)“所有”:方便地實(shí)現(xiàn)所有的醫(yī)學(xué)服務(wù)和面向所有的地方。
(四)遠(yuǎn)程醫(yī)療系統(tǒng)與信息技術(shù)
很顯然,遠(yuǎn)程醫(yī)療(Tele-medicine)應(yīng)當(dāng)有許多不同的系統(tǒng)和技術(shù)要求(分級(jí)的)。但大致可分為兩類:實(shí)時(shí)的(RealTime,RT)和先收集后處理的(store-and-forward,SAF)。對(duì)于RT交互模式,病人與現(xiàn)場(chǎng)醫(yī)生或護(hù)理人員一起在遠(yuǎn)處,專家在醫(yī)學(xué)中心。對(duì)于SAF模式,所有相關(guān)的信息(數(shù)據(jù)、圖形、圖像等)用電子方式傳到專家處,在這里,專家的反應(yīng)不必是立即的。在大多數(shù)情況下,幾小時(shí)或幾天后才能收到專家的報(bào)告。一種理想的遠(yuǎn)程醫(yī)療系統(tǒng)當(dāng)然是同時(shí)具備RT和SAF兩種模式,但顯然這種復(fù)合模式意味著顯著增加的費(fèi)用。例如,一個(gè)理想的RT-SAF組合,需要在急診室內(nèi)或附近有一個(gè)基站,并在遠(yuǎn)處有多個(gè)對(duì)病人實(shí)施治療計(jì)劃的地方,那里帶有診斷室或移動(dòng)的監(jiān)護(hù)單元。基站需要有控制系統(tǒng)或工作站、在線的醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)、視頻相機(jī)和監(jiān)護(hù)儀、微型耳機(jī)和話筒以及圖形圖像輸入設(shè)備。在遠(yuǎn)端,需要有完全可移動(dòng)的視頻相機(jī)和監(jiān)護(hù)儀、各種診斷設(shè)備、圖形圖像輸入設(shè)備、PC或工作站等。如上所述,當(dāng)前的技術(shù)可以使得遠(yuǎn)程醫(yī)療系統(tǒng)具有可靠的高質(zhì)量的數(shù)據(jù)和視頻-音頻通信(在醫(yī)學(xué)中心的醫(yī)生和遠(yuǎn)端病人之間),能夠提供與到醫(yī)院就診相當(dāng)?shù)姆?wù)。隨著遠(yuǎn)程醫(yī)療的范圍和廣度的擴(kuò)展,需要進(jìn)一步關(guān)注的技術(shù)和臨床問題包括:傳輸?shù)膱D像、視頻信息的知覺質(zhì)量以及其他臨床完善性所要求的程序;當(dāng)前技術(shù)能夠提供的檢查的透徹性,以及遠(yuǎn)程醫(yī)療服務(wù)和當(dāng)前臨床常規(guī)檢查的有機(jī)結(jié)合問題等。遠(yuǎn)程醫(yī)療當(dāng)中的一個(gè)重要技術(shù)成份是通信系統(tǒng),它的基本的傳輸介質(zhì)是銅質(zhì)電纜、光導(dǎo)纖維,微波中繼,衛(wèi)星轉(zhuǎn)發(fā)。一個(gè)混合的網(wǎng)絡(luò)可能是,衛(wèi)星傳送用于很遠(yuǎn)距離的情況,光纖用于視頻圖像,銅電纜傳數(shù)據(jù)、信號(hào)和控制信息。RT、SAF兩種模式的通信要求都可以預(yù)測(cè)。RT模式要求短時(shí)間內(nèi)傳送大量的信息,它強(qiáng)調(diào)的重點(diǎn)是傳輸、交換和交互的時(shí)間。它的決定性因素是容許能力(傳輸速率和帶寬)。而SAF模式則對(duì)傳輸速率和帶寬的要求不大。只要能將整塊的數(shù)據(jù)傳送就行。一般的多媒體遠(yuǎn)程醫(yī)療系統(tǒng)應(yīng)具有獲取、傳輸、處理和顯示圖像、圖形、語(yǔ)音、文字和生理信息的功能。按照遠(yuǎn)程醫(yī)療系統(tǒng)的組成劃分,它一般由三個(gè)部分構(gòu)成:用戶終端設(shè)備,醫(yī)療中心終端設(shè)備和聯(lián)系中心與用戶的通訊信息網(wǎng)絡(luò)。不同的遠(yuǎn)程醫(yī)療應(yīng)用,對(duì)通訊系統(tǒng)和系統(tǒng)終端設(shè)計(jì)又有不同的要求。相應(yīng)的設(shè)備費(fèi)用也依要求的不同而變動(dòng)較大。
(五)相關(guān)的有待解決的技術(shù)問題
仍然有待解決的,與遠(yuǎn)程醫(yī)療全面、廣泛地實(shí)施有關(guān)的關(guān)鍵技術(shù)問題包括:數(shù)碼醫(yī)院的建立,目前有些醫(yī)院己有醫(yī)院信息系統(tǒng)(HIS)和圖像歸檔與通信系統(tǒng)(PACS—picturearchivingandcommunicationsystem)和DICOM(Digitalimagingandcommuni-cationsinmedicine)。醫(yī)院現(xiàn)有的這些系統(tǒng)是遠(yuǎn)程醫(yī)療的重要組成部分,它們的擴(kuò)展是建立遠(yuǎn)程醫(yī)療系統(tǒng)的一個(gè)有利條件。此外,還需要建立標(biāo)準(zhǔn)的醫(yī)學(xué)信息庫(kù);開發(fā)功能可靠、操作方便的終端設(shè)備•以及接口技術(shù)問題,因?yàn)檫h(yuǎn)程醫(yī)療系統(tǒng)涉及多種醫(yī)療設(shè)備與通訊系統(tǒng)的連接,建立通用的標(biāo)準(zhǔn)接口將會(huì)減少系統(tǒng)建立時(shí)的復(fù)雜程度和節(jié)省費(fèi)用;系統(tǒng)加密問題,以確保醫(yī)療數(shù)據(jù)在通訊網(wǎng)絡(luò)傳輸中的安全性,維護(hù)病人的隱私權(quán);家庭以及偏遠(yuǎn)地區(qū)的寬頻通訊問題,初期通訊網(wǎng)絡(luò)的鋪建應(yīng)考慮到遠(yuǎn)程醫(yī)療的用途。目前,有關(guān)研究主要集中在:(1)人-機(jī)接口和通訊網(wǎng)絡(luò)的研究,主要解決各種信息的有效上網(wǎng)和傳送;(2)傳感器技術(shù)的研究,目標(biāo)在于研制有源、無線和小型的換能器,實(shí)現(xiàn)生理信號(hào)的方便而可靠、準(zhǔn)確而無損的測(cè)量;(3)各種先進(jìn)的數(shù)據(jù)與圖像壓縮方法的研究,在盡可能減低有用信息丟失的同時(shí),達(dá)到盡可能高的壓縮率,最終實(shí)現(xiàn)遠(yuǎn)程醫(yī)療數(shù)據(jù)與圖形圖像信息的的高效傳輸;(4)醫(yī)學(xué)信息與數(shù)據(jù)傳輸安全問題的研究,為相應(yīng)的立法等提供技術(shù)保證。
二、醫(yī)學(xué)成像技術(shù)與三維醫(yī)學(xué)圖像處理
(一)醫(yī)學(xué)成像技術(shù)
1895年德國(guó)物理學(xué)家倫琴發(fā)現(xiàn)了X射線,并被應(yīng)用于醫(yī)學(xué),產(chǎn)生了以X光照片為標(biāo)志的醫(yī)學(xué)影象學(xué)。此后的整個(gè)20世紀(jì)可以說是醫(yī)學(xué)成像的盛世。面對(duì)各種紛紛涌現(xiàn)的眾多成像模式,我們不僅要問:這些成像技術(shù)各有何特點(diǎn)?它們的發(fā)展前景又如何呢?到目前為止出現(xiàn)的所有成像方法,幾乎都與核或電磁有關(guān)。如果從利用的電磁波的頻率高低上對(duì)醫(yī)學(xué)成像模式進(jìn)行分類,在靜態(tài)場(chǎng)領(lǐng)域有電生理成像,低頻領(lǐng)域有阻抗CT,高頻領(lǐng)域有微波CT,光領(lǐng)域有光學(xué)CT,在更高的頻率領(lǐng)域有X線CT。其中X線CT早已進(jìn)入實(shí)用的階段。此外還有利用磁場(chǎng)相互作用機(jī)制的磁共振成像技術(shù)(MRI)。加上最近受到重視的一些功能成像方法,如功能磁共振成(fMRI)和正電子發(fā)射斷層掃描技術(shù)(PositronEmissionTomography,PET)等,如此眾多的醫(yī)學(xué)影象手段提供了大量的有關(guān)病人的各種信息,包括形態(tài)的和功能的、靜態(tài)的和動(dòng)態(tài)的等,被廣泛應(yīng)用于診斷和治療,成為現(xiàn)代化中必不可少的手段和工具。
1•電阻抗斷層成像技術(shù)
電阻抗斷層成像技術(shù)(ElectricalImpedanceTomography,EIT)是近些年來興起的一項(xiàng)醫(yī)學(xué)成像技術(shù)。其基本思想是利用人體組織的電特性差異形成人體內(nèi)部的圖像。它通過體表電極向人體送入一交流電流,在體表不同部位測(cè)量產(chǎn)生的電壓值,由此重檢一幅電極位置平面的人體組織電特性圖像。這種圖像不僅包含了解剖學(xué)信息,更為重要的是,某些組織和器官的電特性隨其功能狀態(tài)而改變,因此圖像也包含了功能信息在內(nèi)。此外加上對(duì)人體幾乎無創(chuàng)傷、廉價(jià)、操作簡(jiǎn)便等優(yōu)點(diǎn),EIT受到了日益廣泛的關(guān)注。但由于受到數(shù)據(jù)采集系統(tǒng)和算法等因素的限制,目前該技術(shù)并不十分成熟,基本處于實(shí)驗(yàn)室階段。EIT技術(shù)根據(jù)測(cè)量目標(biāo)的不同可以分為兩類:靜態(tài)EIT和動(dòng)態(tài)EIT。靜態(tài)EIT以測(cè)量對(duì)象內(nèi)部電阻(導(dǎo))率的分布為成像目標(biāo);而動(dòng)態(tài)EIT則是測(cè)量對(duì)象內(nèi)部的電阻(導(dǎo))率的相對(duì)變化量的分布為成像目標(biāo)。由于動(dòng)態(tài)EIT技術(shù)只需反映阻抗的相對(duì)變化量,相應(yīng)地,其算法簡(jiǎn)便、快速,可以實(shí)時(shí)成像,而且系統(tǒng)對(duì)具體目標(biāo)形狀有較高的魯棒性。雖然由于假設(shè)條件難以滿足、推導(dǎo)過程不嚴(yán)格等缺點(diǎn)使得動(dòng)態(tài)EIT的成像質(zhì)量不高,但由于其對(duì)人體形狀和電極擺放位置的適應(yīng)性強(qiáng)、能反映變化的信息等優(yōu)于靜態(tài)EIT的這些優(yōu)點(diǎn),它已被用來進(jìn)行臨床研究。相信隨著算法的改進(jìn)和成像質(zhì)量的提高,動(dòng)態(tài)EIT有望在臨床上發(fā)揮更大的作用。
2•電生理成像技術(shù)
電生理成像技術(shù)指基于體表電磁信號(hào)的觀測(cè),進(jìn)行的體內(nèi)電活動(dòng)情況成像的技術(shù)。具體有心電磁和腦電磁問題兩大類。但兩類問題在技術(shù)上是密切相關(guān)的,它們分別是利用測(cè)量得到的心電圖(Electrocardiogram,ECG)和腦電圖(Electroen-cephalogram,EEG)來研究人體的功能。這里以腦電為例,其中又可以分為兩個(gè)層次,一為腦電源反演,一為成像。在成像方面,人們希望能從頭皮上獲得的空間分辨率較低的電位分布推算出皮層表面上空間分辨率較高的腦電電位分布,因也稱為高分辨率EEG成像。人們相繼發(fā)展了等效源方法(Sidmanetal,1992;Yao,2000),有限電阻網(wǎng)絡(luò)法(楊福生等,1999),和球諧譜分析方法(Yao,1995)。腦電源反演就是利用測(cè)得的頭皮電位,推算顱骨內(nèi)腦電活動(dòng)源的空間位置的一項(xiàng)技術(shù)。其具體方法有非線性優(yōu)化算法和子空間分解算法。在這些方法中,大都是以某一時(shí)刻的電位觀測(cè)值為已知信息,唯有子空間分解算法是直接建立在一段觀測(cè)記錄之上,從而較好地同時(shí)利用了觀測(cè)記錄中的時(shí)間和空間信息,因而受到了廣泛的重視(Mosher,1992;堯德中,2000)。電生理成像技術(shù)與其它的醫(yī)學(xué)成像技術(shù)如CT、MRI等相比,具有其不可替代的獨(dú)特功能。它檢測(cè)的是生物體的自發(fā)(或誘發(fā))的功能信息,是一種真正的非損傷性的成像技術(shù),且可以進(jìn)行長(zhǎng)期檢測(cè),而fMRI等只能檢測(cè)誘發(fā)的間接的功能信息。另外一個(gè)優(yōu)點(diǎn)就是它具有很高的時(shí)間分辨率。目前的一個(gè)重要發(fā)展方向是,電生理成像技術(shù)與其它影像技術(shù)相結(jié)合(如EEG與fMRI結(jié)合),實(shí)現(xiàn)優(yōu)勢(shì)互補(bǔ),以得到兩“高”(高時(shí)間分辨率和高空間分辨率)的結(jié)果,幫助研究人員進(jìn)行更精確的分析和判斷。
3•微波CT
微波CT可以說是一種比較新的成像模式,它是1978年才被提出來的。它的基本原理是:利用電磁波的傳輸特性,通過測(cè)定透過身體的電磁波來重建體內(nèi)圖像。微波CT大體可以分為兩大類:被動(dòng)測(cè)定型和主動(dòng)測(cè)定型。被動(dòng)測(cè)定型也可以稱為無源型,利用的是由生物體發(fā)出的屬于微波范圍的那一部分電磁波,如人體熱輻射等,最終獲得熱圖像(因此,類似的還有紅外成像);主動(dòng)測(cè)定型也叫有源型,是用外部入射微波照射生物體,然后利用透過微波和反射微波重構(gòu)圖像,獲得的是形態(tài)圖像。微波CT作為一種醫(yī)學(xué)成像模式,它的主要特點(diǎn)是,同X-CT相比更容易查出癌變組織;與超聲相比更有利于肺的診斷;不存在電離輻射的危險(xiǎn)性。微波CT需要解決的最大問題是如何提高空間分辨率。要想提高分辨率,必須縮短波長(zhǎng),提高頻率,但波長(zhǎng)愈短其在體內(nèi)的衰減愈大。同時(shí),微波在介質(zhì)中傳播時(shí)產(chǎn)生的衍射和散射會(huì)造成重建圖像的模糊。所以提高微波CT的圖像分辨率是一件極為困難的工作。隨著技術(shù)的進(jìn)步和圖像分辨率的提高,微波CT將很有希望成為新一代的醫(yī)學(xué)成像手段。
4•光學(xué)CT
光學(xué)CT也將是21世紀(jì)的重要研究領(lǐng)域。其基本思路是將光輸入待測(cè)組織,測(cè)量其輸出,重建該組織。由于人體對(duì)可見光是屏蔽的,但對(duì)紅外或紅外波段的光有一定的穿透能力,利用它進(jìn)行斷層成像。光學(xué)CT大致可以分為內(nèi)稟(Intrinsic)光學(xué)成像、光學(xué)相干層析成像、光子遷移技術(shù)成像等幾種。內(nèi)稟信號(hào)指的是,由組織活動(dòng)(如神經(jīng)元活動(dòng))引起的有關(guān)物質(zhì)成分、運(yùn)動(dòng)狀態(tài)的改變而導(dǎo)致起光學(xué)特性發(fā)生變化,而這種變化在與某些特定波長(zhǎng)的光量子相互作用后得到的包含了這些特性的光信號(hào)。通過成像儀器探測(cè)到這些光信號(hào)的某一時(shí)間間隔內(nèi)的空間分布,進(jìn)而重建組織圖像。無損傷內(nèi)稟光學(xué)成像方法近年來正加緊研究,以期用于人腦功能的研究。光學(xué)相干層析成像,即將光學(xué)相干剖析術(shù)(OCT)用于成像,它是采用低相干的近紅外光作為光源,采用特制干涉儀完成光的相干選通,這樣接收到的信號(hào)就只包含尺度相應(yīng)于相干長(zhǎng)度的一薄層生物組織的信息。若同時(shí)加以掃描,就能得到三維剖析圖像。OCT技術(shù)從提出至今雖然只有短短幾年的時(shí)間,但已表現(xiàn)出極為誘人的應(yīng)用前景。目前它已在視網(wǎng)膜及黃斑疾病的早期診斷,皮膚、腸、胚胎檢測(cè)等領(lǐng)域發(fā)揮出巨大的作用。這種技術(shù)已成為國(guó)內(nèi)外在生物光學(xué)方面的一個(gè)活躍點(diǎn)。利用靈敏的探測(cè)器和適當(dāng)?shù)闹貦z算法,就可以確定測(cè)量組織的光學(xué)特性。通過檢測(cè)組織的光學(xué)特性,可用于腫瘤診斷、代謝狀態(tài)動(dòng)態(tài)監(jiān)護(hù)、藥物分析及光動(dòng)力學(xué)治療等場(chǎng)合。光子遷移技術(shù)成像(PhotonMigrationImaging,PMI)利用的是在紅光和近紅外光譜區(qū),生物組織的某些不同成分對(duì)于光的散射和吸收表現(xiàn)出不同特性,而且在不同生理狀態(tài)下的組織光學(xué)參數(shù)也不大相同。高頻調(diào)控的正弦入射光經(jīng)組織傳播后,由于吸收和散射延遲了光子行程時(shí)間,引起了相位和光子能量密度的變化,顯著和精確的相位變化體現(xiàn)了吸收的變化。光學(xué)方法正處于迅速發(fā)展之中,一方面,與XCT、MRI等其它成像方法相比,光學(xué)CT具有價(jià)格低廉、運(yùn)行安全,另一方面,它體積小重量輕,特征信號(hào)容易獲得,技術(shù)發(fā)展成熟。光學(xué)CT還有一個(gè)吸引人的優(yōu)勢(shì)是,它在空間分辨力和時(shí)間分辨力這兩個(gè)基本的成像性能上可以說是首屈一指,目前已達(dá)約5mm的物方象素和每秒25幀以上的視頻速度。因而可以預(yù)料,光學(xué)CT會(huì)在醫(yī)學(xué)研究和臨床等方面發(fā)揮越來越大的作用。
5•正電子發(fā)射斷層掃描技術(shù)
正電子發(fā)射斷層掃描技術(shù)(PositronEmissionTomography,PET)作為一種傳統(tǒng)的核醫(yī)學(xué)成像技術(shù),它的歷史可以追溯到1932年,在那一年CarlAnderson在研究宇宙射線所拍的云室照片時(shí)發(fā)現(xiàn)了β+的存在;此后不久ErnestLawrence發(fā)明了可發(fā)射β+核素的回旋加速器,這些是實(shí)施PET的兩個(gè)不可缺少的前提條件。PET的成像原理是,將由發(fā)射正電子β+的核素標(biāo)記的藥物由靜脈注入人體,隨血液循環(huán)至全身。正電子與人體內(nèi)的電子相遇并湮滅產(chǎn)生兩個(gè)背對(duì)背的γ光子,這對(duì)具有確定能量的光子可以穿透人體,被體外的探測(cè)器接收,從而得到正電子在體內(nèi)的三維密度分布及這種分布隨時(shí)間變化的信息。PET的標(biāo)記藥物很豐富,且這些核素的半衰期都很短,病人所受到的輻射劑量可以說是微乎其微,并可在短期內(nèi)進(jìn)行重復(fù)測(cè)量。盡管PET具有近乎無損的測(cè)量、三維動(dòng)態(tài)成像、定量檢測(cè)化學(xué)物質(zhì)分布及實(shí)現(xiàn)真正的功能成像等獨(dú)特的優(yōu)點(diǎn),但早期由于對(duì)短壽命核素認(rèn)識(shí)的不足及探測(cè)技術(shù)缺乏等原因,直到1976年第一臺(tái)全身(whole-body)PET才正式投入市場(chǎng)并應(yīng)用于臨床。此后PET才真正開始進(jìn)入了一個(gè)蓬勃發(fā)展的時(shí)期。目前全世界已有上百家的PET中心,利用PET進(jìn)行臨床醫(yī)學(xué)、基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、腦科學(xué)等方面的研究。在臨床方面,主要用于診斷神經(jīng)類疾病、心臟疾病、癌癥等,也可輔助設(shè)計(jì)治療方案和評(píng)估藥物療效,并可用于探討一些神經(jīng)類疾病的發(fā)病機(jī)制。因?yàn)楦鞣N精神類疾病,如癲癇、精神分裂癥、癡呆等,以及腦腫瘤、腦血管病等,都將引起血流、葡萄糖和氧代謝的異常,PET即可通過測(cè)量這些生理參數(shù)來診斷疾病。同時(shí),PET的獨(dú)特優(yōu)點(diǎn)也給神經(jīng)科學(xué)提供了觀測(cè)手段,被越來越多地用來研究人類的學(xué)習(xí)、思維、記憶等的生理機(jī)制,幫助人類進(jìn)一步了解自身。因?yàn)榻o正常人不同的刺激(如光、語(yǔ)言等)或讓其進(jìn)行不同的活動(dòng)(如記憶、學(xué)習(xí)、喜怒哀樂等),也將引起不同腦區(qū)域的血流和代謝的變化,進(jìn)而幫助研究腦的功能。相信在不遠(yuǎn)的將來,隨著PET技術(shù)的進(jìn)一步成熟,PET將會(huì)成為診斷和研究上不可缺少的工具。
6•X-線成像技術(shù)
X-線成像技術(shù)可以說是在醫(yī)院當(dāng)中應(yīng)用的最傳統(tǒng)、最廣泛的一種醫(yī)學(xué)影象技術(shù)。X-線圖像建立在當(dāng)X-線透過人體時(shí),各種臟器與組織對(duì)X-線的不同吸收程度的基礎(chǔ)上,因而接收端將得到不同強(qiáng)度的射線,傳統(tǒng)的做法是將之記錄在膠片上得到X膠片。隨著電子技術(shù)的發(fā)展,這種傳統(tǒng)方法的弊端日趨突顯出來。當(dāng)X-線圖像一旦形成,其圖像質(zhì)量便不能做進(jìn)一步改善;不便于計(jì)算機(jī)處理,也不便于存儲(chǔ)、傳輸和共享等。在評(píng)價(jià)20世紀(jì)X成像技術(shù)時(shí),多數(shù)資深專家均認(rèn)為影像的數(shù)字化是最新、最熱門及最重要的進(jìn)展。數(shù)字化成像可以利用大容量磁、光盤存儲(chǔ)技術(shù),以數(shù)字化的電子方式存儲(chǔ)、管理、傳送、處理、顯示醫(yī)學(xué)影象及相關(guān)信息,使臨床醫(yī)學(xué)徹底擺脫對(duì)傳統(tǒng)硬拷貝技術(shù)的依賴,真正實(shí)現(xiàn)X-攝影的無膠片化。目前采用的直接數(shù)字化X-線影象的方法主要有兩種:直接X-線影象探測(cè)儀(DirectRadiographyDetector,DRD)和平板探測(cè)儀(FlatPanelDetector,FPD)。DRD最早由Sterling公司申請(qǐng)專利,現(xiàn)已進(jìn)入商品化階段。FPD由Trexell公司研制成功。這兩項(xiàng)技術(shù)的發(fā)展方向均是設(shè)法進(jìn)一步提高分辨率和實(shí)時(shí)性。數(shù)字影像可以說是伴隨著計(jì)算機(jī)技術(shù)的發(fā)展應(yīng)運(yùn)而生。1981年第15屆國(guó)際放射醫(yī)學(xué)會(huì)議上首次展出了數(shù)字放射新產(chǎn)品。進(jìn)入90年代中后期,國(guó)外已經(jīng)推出了多種新型的數(shù)字化X-線影象裝置;傳統(tǒng)X-線裝置中的X-線乳腺影像設(shè)備也已數(shù)字化。到目前為止,市場(chǎng)上的數(shù)字化的X-線影像設(shè)備已占70%以上??梢灶A(yù)期,數(shù)字化的X-線影像設(shè)備將逐步成為市場(chǎng)的主宰,并將使21世紀(jì)的X-線診斷發(fā)生令人矚目的變化。
7•磁共振成像(MRI)
在磁共振成像(MagneticResonanceImaging,MRI)領(lǐng)域,自從1946年哈佛大學(xué)的E•M•Purcell和斯坦福大學(xué)的F•Bloch發(fā)現(xiàn)了核磁共振現(xiàn)象并因此獲得1952年諾貝爾物理獎(jiǎng)起,直到70年代初,它一直沿著高分辨核磁共振波譜學(xué)的方向發(fā)展,成為化學(xué)、生物學(xué)等領(lǐng)域研究分子結(jié)構(gòu)不可缺少的分析工具。1972年R•Damadian注冊(cè)了第一個(gè)關(guān)于核磁共振成像的專利,提出了磁共振成像的思想,并指出可以用磁共振成像儀掃描人體檢查疾病。1982年MRI掃描儀開始應(yīng)用于臨床。由于質(zhì)子(1H)結(jié)構(gòu)簡(jiǎn)單,磁性較強(qiáng),是構(gòu)成水、脂肪和碳水化合物的基本成分,所以目前醫(yī)學(xué)上主要利用質(zhì)子(1H)進(jìn)行MRI成像。其成像主要利用磁共振原理,以一定寬度的射頻脈沖磁場(chǎng)使具有磁性核的原子產(chǎn)生共振激發(fā);被激發(fā)的原子核的退激時(shí)間的長(zhǎng)短反映了磁性核周圍的環(huán)境情況。通過測(cè)量生物組織退激過程中磁化強(qiáng)度的變化,即可獲取反映內(nèi)部結(jié)構(gòu)的圖像。磁共振成像由于其空間分辨率高、對(duì)人體危害性小、又能提供大量的解剖結(jié)構(gòu)信息等優(yōu)點(diǎn)而被廣泛應(yīng)用于臨床診斷。隨著技術(shù)的發(fā)展和需求的提高,動(dòng)態(tài)成像或功能成像是未來世紀(jì)MRI的研究方向(functionalMRI,fMRI)。一個(gè)成功的應(yīng)用是用外面的造影劑或內(nèi)生的血氧度相關(guān)效應(yīng)(BOLD)描述視覺皮層的活動(dòng)。BOLD的成像原理是基于血紅蛋白的磁化率隨脫氧過程而急劇變化。在靜脈血管內(nèi)脫氧血紅蛋白濃度發(fā)生變化時(shí),會(huì)在血管周圍引起磁場(chǎng)畸變,而這種變化可以被探測(cè)記錄下來。在功能神經(jīng)科學(xué)研究領(lǐng)域中,BOLD成像有很多優(yōu)點(diǎn)。這類研究完全非侵入性,產(chǎn)生的圖像數(shù)據(jù)與解剖結(jié)構(gòu)的數(shù)據(jù)是完全配準(zhǔn)的。BOLD技術(shù)已經(jīng)發(fā)展得比較好,它在解釋大腦在正常和病理狀態(tài)的功能方面很有前途。迄今為止,fMRI雖然只有短短幾年的歷史,但理論與實(shí)驗(yàn)都已取得了許多有重要意義的結(jié)果。它的最大優(yōu)點(diǎn)是無損傷(不用外源介質(zhì)),可以直接進(jìn)行反復(fù)的非侵入性的功能測(cè)量。與同樣屬于功能成像的PET相比,fMRI則是更新的技術(shù),成像速度比PET快,而且提供了更好的空間分辨率。fMRI未來的發(fā)展方向是,一要進(jìn)一步加強(qiáng)對(duì)fMRI信號(hào)的實(shí)質(zhì)的認(rèn)識(shí)和理解,這是基本的前提。另一方面,從實(shí)驗(yàn)設(shè)備的硬件和軟件的結(jié)合上進(jìn)一步提高靈敏度和分辨率(包括時(shí)間分辨率和空間分辨率),這是核磁共振現(xiàn)象的本質(zhì)決定的一個(gè)永恒的研究主題。除了以上與電磁或射線相關(guān)的成像技術(shù)外,還有基于超聲波的多種結(jié)構(gòu)、組織和功能的成像技術(shù),這里不再詳述。
(二)三維醫(yī)學(xué)圖像處理
醫(yī)學(xué)圖像處理是指對(duì)已獲得的圖像作進(jìn)一步的處理,其目的或者是使不夠清晰的圖像復(fù)原,或者是為了突出圖像中的某些特征信息,或者是對(duì)圖像做模式分類等。隨著技術(shù)的發(fā)展,醫(yī)學(xué)圖像的處理已開始從二維轉(zhuǎn)向了三維,以求從中獲得更多的有用信息。三維醫(yī)學(xué)圖像分析所包含的研究問題很廣,目前主要有:圖像的分割、邊緣檢測(cè)、多模式圖像和數(shù)據(jù)的配準(zhǔn)(Registration)和融合(Fusion)、虛擬現(xiàn)實(shí)技術(shù)、圖像的快速重建和顯示、圖像處理算法性能評(píng)估、信息集成(Informationintegration)和傳輸技術(shù)等。所有這些的研究都可以集中到如下兩個(gè)方面:
1•圖像的融合和可視化
醫(yī)學(xué)影象技術(shù)的發(fā)展為臨床診斷和治療提供了包括解剖圖像和功能圖像在內(nèi)的多種圖像模式。臨床上通常需要將同一個(gè)病人的多種成像結(jié)果結(jié)合起來進(jìn)行分析,以提高醫(yī)學(xué)診斷和治療水平。比如在放射治療中,CT掃描可以用于計(jì)算放射劑量的分布,而MRI可以很好地定位病灶區(qū)域的輪廓。常規(guī)的方法(如將幾張圖像膠片掛在燈箱上)使醫(yī)生很難對(duì)幾幅不同的圖像進(jìn)行定量分析,首先要解決的這幾幅圖像的嚴(yán)格對(duì)準(zhǔn)問題。所謂醫(yī)學(xué)圖像配準(zhǔn)與融合,就是通過尋找某種空間變換,用計(jì)算機(jī)圖像處理技術(shù)使各種影象模式統(tǒng)一在一個(gè)公共坐標(biāo)系里,融合成一個(gè)新的影象模式顯示在計(jì)算機(jī)屏幕上,使多幅圖像的對(duì)應(yīng)點(diǎn)達(dá)到空間位置和解剖結(jié)構(gòu)上的完全一致,并突出顯示病灶或感興趣部位,幫助醫(yī)生進(jìn)行臨床診斷,制定放射治療計(jì)劃和評(píng)價(jià)等。近年來醫(yī)學(xué)圖像配準(zhǔn)和融合技術(shù)的研究和應(yīng)用日趨受到醫(yī)學(xué)界和工程界的重視。對(duì)醫(yī)學(xué)圖像匹配方法的分類可以有多種不同的標(biāo)準(zhǔn)。1993年,VandenElsen等人對(duì)醫(yī)學(xué)圖像匹配的方法進(jìn)行了分類,歸納出了多達(dá)七種分類標(biāo)準(zhǔn)。一般的匹配方法的實(shí)現(xiàn)步驟為:特征提取;特征配對(duì);選取圖象之間的幾何變換、確定參數(shù);執(zhí)行變換?;谔卣鼽c(diǎn)選取的不同,匹配算法可以分為兩種:基于外部特征的圖像配準(zhǔn)方法和基于內(nèi)部特征的圖像配準(zhǔn)方法?;谕獠刻卣鞯膱D像配準(zhǔn)通常是在研究對(duì)象上設(shè)置一些標(biāo)志點(diǎn)(如采用螺絲植入骨頭方法固定立體定位框架等),使這些標(biāo)志點(diǎn)在不同的影象模式中均有顯示,然后以這些共同的標(biāo)準(zhǔn)點(diǎn)為標(biāo)準(zhǔn)對(duì)圖像進(jìn)行配準(zhǔn)。這種配準(zhǔn)方法因?yàn)椴皇軋D像畸變等因素的影響,所以精度很高,可達(dá)1~2mm,可以作為評(píng)估基于內(nèi)部特征的圖像配準(zhǔn)方法的標(biāo)準(zhǔn)。但其植入式的特點(diǎn)會(huì)給患者帶來一定的痛苦,一般僅限于手術(shù)室使用。目前的研究集中在基于內(nèi)部特征的圖像配準(zhǔn)方法上,這種方法一般是用圖像分割方法提取醫(yī)學(xué)圖像中相對(duì)運(yùn)動(dòng)較小的解剖結(jié)構(gòu),如點(diǎn)(血管分叉點(diǎn)等)、2D輪廓線、3D曲面等。用這些提取出來的特征對(duì)之間的位置變化和變形來確定圖像之間的變換和配準(zhǔn)。配準(zhǔn)的精度取決于圖像分割的準(zhǔn)確性。這種方法優(yōu)點(diǎn)之一就是其回溯性,即以前獲取的圖像(沒有外標(biāo)記點(diǎn))也可以用內(nèi)部特征點(diǎn)進(jìn)行匹配。目前,基于內(nèi)部特征的圖像配準(zhǔn)方法比較成熟并已廣泛應(yīng)用于臨床。但目前大多數(shù)模糊動(dòng)態(tài)圖像的精確分割和特征提取仍是一個(gè)尚未完全解決的問題。最近又發(fā)展了一種直接利用所謂的基于體素相似性的配準(zhǔn)方法,又稱為相關(guān)性方法,它是直接利用不同成像模式的灰度信息的統(tǒng)計(jì)特性進(jìn)行全局最優(yōu)化匹配,不需要進(jìn)行分割和特征提取。因此這種方法一般都較為穩(wěn)定,并能獲得相當(dāng)準(zhǔn)確的結(jié)果。但是它的缺點(diǎn)是對(duì)圖像中的噪聲信號(hào)敏感,計(jì)算量巨大。在目前出現(xiàn)的各種相關(guān)性算法,如互相關(guān)法(correlation)、聯(lián)合熵法(jointentropy)、相對(duì)熵法(relativeentropy)等算法當(dāng)中,臨床評(píng)估的結(jié)果是相對(duì)熵法(又稱為互信息法,mutualinformation)是最精確的。醫(yī)學(xué)影像的三維重建和可視化也是一個(gè)值得關(guān)注的問題。常規(guī)影像如CT、MRI等得到的均為組織的二維切片,醫(yī)生很難直接利用它們進(jìn)行分析、診斷和治療。三維醫(yī)學(xué)圖像的重建將有助于觀察復(fù)雜結(jié)構(gòu)的立體形態(tài);有利于醫(yī)生制定放射治療計(jì)劃;有助于神經(jīng)外科手術(shù)的實(shí)施;有助于對(duì)不同治療方案進(jìn)行評(píng)估等。對(duì)三維圖像重建算法的研究,近幾年來國(guó)內(nèi)外學(xué)者進(jìn)行了許多探討。目前通用的做法是,先從切片圖像中提取出物體輪廓信息,重建三維結(jié)構(gòu),再由計(jì)算機(jī)圖形學(xué)中的光線跟蹤法(RayTracing),根據(jù)一定的光照模型和給定的觀察角度、光源強(qiáng)度和方位來模擬自然景物光照效果,計(jì)算物體表面各點(diǎn)的灰度值,最終構(gòu)成一幅近似自然景物的三維組織或器官圖像。目前各種各樣的圖像所涉及的數(shù)據(jù)量越來越大,各種算法也越來越復(fù)雜,所以處理時(shí)間也較長(zhǎng),而用戶則希望實(shí)時(shí)、快速地得到圖像處理結(jié)果,及時(shí)用于診斷與治療。因此,醫(yī)學(xué)圖像處理的加速也是一個(gè)主要的研究方向。為了提高系統(tǒng)的運(yùn)行速度,當(dāng)然有許多方法可以考慮。除了算法上的改進(jìn)外,應(yīng)用多處理器進(jìn)行醫(yī)學(xué)圖像處理與分析的加速是一種不錯(cuò)的方法。在有些情況下可以直接利用DSP進(jìn)行加速。
2•基于影象的計(jì)算機(jī)輔助治療方法及系統(tǒng)
發(fā)展各種醫(yī)學(xué)影象的最終目的就是為了更細(xì)致的了解人體的結(jié)構(gòu)和功能,輔助醫(yī)生對(duì)病人做出診斷和治療,提高人類的生活質(zhì)量。目前以此為目標(biāo)的研究主要有:基于影象的三維放療計(jì)劃系統(tǒng)、立體外科手術(shù)仿真系統(tǒng)、醫(yī)學(xué)中的虛擬現(xiàn)實(shí)系統(tǒng)等。在過去的放射治療時(shí),先有醫(yī)生根據(jù)CT或MRI膠片上的定位標(biāo)志點(diǎn)來計(jì)算病灶的三維坐標(biāo),然后根據(jù)病灶位置和形狀布置焦點(diǎn),經(jīng)計(jì)算機(jī)計(jì)算出等劑量線,在燈箱上用打印輸出的劑量線與膠片上的病灶進(jìn)行對(duì)比,如不吻合則重新規(guī)劃焦點(diǎn)。反復(fù)重復(fù)直到滿意為止。最后計(jì)算出每個(gè)焦點(diǎn)的治療時(shí)間??偟恼f來這個(gè)過程很不方便,而且可能會(huì)引起很大的誤差。目前臨床上開始采用的三維放射治療計(jì)劃系統(tǒng)則大大方便了腫瘤醫(yī)師的工作。在整個(gè)治療計(jì)劃的計(jì)算機(jī)化過程中,可以說是涉及到了三維醫(yī)學(xué)圖像處理的各個(gè)環(huán)節(jié),如圖像配準(zhǔn)與融合、輪廓提取、三維重建等。三維放療計(jì)劃系統(tǒng)的推出不僅提高了醫(yī)生的工作效率,而且精度大大提高,是以后腫瘤治療中心制定放療計(jì)劃的常規(guī)工具。今后放射治療的方向是適形放射治療(ConformalRadiotherapy,CR)。該方法通過旋轉(zhuǎn)照射或靜態(tài)多射野照射,使得高劑量區(qū)劑量分布的形狀在三維上與靶區(qū)(病灶)的實(shí)際形狀一致,同時(shí)盡可能地降低靶區(qū)周圍的健康組織和重要器官(如脊髓)的照射量,從而大大提高治療效果。CR由于能夠調(diào)整射野內(nèi)的射線強(qiáng)度分布,故又稱為調(diào)強(qiáng)放療(Intensity-modulationRadiotherapy,IMRT)。調(diào)強(qiáng)算法根據(jù)醫(yī)生指定的限制因素計(jì)算每個(gè)射野的最接近醫(yī)生要求的強(qiáng)度分布,是一個(gè)典型的多參數(shù)優(yōu)化問題。1989年,英國(guó)科學(xué)家S•Webb首次提出采用模擬退火法求解最佳強(qiáng)度分布。此后各種調(diào)強(qiáng)算法可以說是層出不窮,成為當(dāng)今放療中的一個(gè)熱點(diǎn)。隨著多葉準(zhǔn)直器技術(shù)(Multiple-LeafCollimator,MLC)的發(fā)展,醫(yī)生可望給出單次腫瘤致死劑量,起到外科手術(shù)的效果。虛擬現(xiàn)實(shí)(VirtualReality,VR)就是力求部分或全部地用一個(gè)計(jì)算機(jī)合成的人工環(huán)境代替一個(gè)現(xiàn)實(shí)世界的真實(shí)環(huán)境,讓使用者在這個(gè)三維環(huán)境中實(shí)時(shí)漫游和交互操作。VR是綜合人機(jī)界面、圖形學(xué)、傳感技術(shù)、高性能計(jì)算機(jī)和網(wǎng)絡(luò)等的一門新興學(xué)科,涉及學(xué)科面廣且發(fā)展十分迅速。VR在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用前景非常廣泛,Rosen認(rèn)為,VR將構(gòu)成最終實(shí)用的手術(shù)模擬器。隨著醫(yī)學(xué)成像可視化和虛擬現(xiàn)實(shí)技術(shù)的發(fā)展,科學(xué)家們已經(jīng)有可能建立起一個(gè)具有部分人體特性的虛擬人體。由美國(guó)國(guó)家醫(yī)學(xué)圖書館(NLM)發(fā)起的可視人計(jì)劃(VisibleHumanProjects,VHP)正是基于這樣的目的。虛擬人體可以提供模擬的診斷、治療、計(jì)算機(jī)成像、內(nèi)窺鏡手術(shù)等等。例如在內(nèi)窺鏡手術(shù)中,外科醫(yī)生通過觀察電視屏幕來操作插入病人體內(nèi)的手術(shù)器械。虛擬環(huán)境技術(shù)可大大改善這種手術(shù)過程。事實(shí)上,虛擬內(nèi)窺鏡系統(tǒng)(Virtualendoscopy)是目前發(fā)展比較快的一個(gè)方面。
三、網(wǎng)絡(luò)化醫(yī)學(xué)儀器人才的培養(yǎng)
生物醫(yī)學(xué)工程專業(yè)的范疇很廣,各高校的側(cè)重點(diǎn)各不相同。我校本學(xué)科專業(yè)與其它高校相比具有明顯的時(shí)代特色。我們一向以電子學(xué)、計(jì)算機(jī)科學(xué)為支撐平臺(tái),強(qiáng)調(diào)與生物醫(yī)學(xué)、醫(yī)療儀器相結(jié)合,在醫(yī)療儀器的智能控制、管理方面有很強(qiáng)的優(yōu)勢(shì)。隨著以上醫(yī)學(xué)信息技術(shù)的發(fā)展,我們提出了依拓本校的優(yōu)勢(shì)專業(yè)如通信、計(jì)算機(jī)、自動(dòng)控制、儀器測(cè)試等,在我校生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)科培養(yǎng)網(wǎng)絡(luò)化、智能化醫(yī)學(xué)儀器方向人才的設(shè)想。
(一)培養(yǎng)網(wǎng)絡(luò)化醫(yī)學(xué)儀器人才的依據(jù)
計(jì)算機(jī)及網(wǎng)絡(luò)技術(shù)飛速發(fā)展,世界正進(jìn)入一個(gè)數(shù)字化的時(shí)代。在醫(yī)療領(lǐng)域,數(shù)字診斷設(shè)備也逐漸成為一種新標(biāo)準(zhǔn),被越來越多的醫(yī)院和用戶所接受。各大廠商相繼推出數(shù)字X光機(jī)、CT、B超等,在一些發(fā)達(dá)國(guó)家,已經(jīng)取代常規(guī)設(shè)備成為臨床診斷的主流。醫(yī)療設(shè)備已經(jīng)到了一個(gè)更新?lián)Q代的時(shí)期。而DICOM標(biāo)準(zhǔn)的制訂,則使醫(yī)療信息實(shí)現(xiàn)了網(wǎng)絡(luò)模式的資源共享和遠(yuǎn)程傳輸。無疑,數(shù)字化、網(wǎng)絡(luò)化將是21世紀(jì)醫(yī)學(xué)發(fā)展的主流。而遠(yuǎn)程醫(yī)療系統(tǒng)則以其迅猛的發(fā)展勢(shì)頭為人們勾畫出了一幅“讓每一位醫(yī)生都成為專家,讓每一位患者都能請(qǐng)得到專家”的美好前景。社會(huì)的需求為高等院校的人才培養(yǎng)提出了新的要求,同時(shí)具有醫(yī)學(xué)知識(shí)和網(wǎng)絡(luò)技能的復(fù)合型人才將會(huì)受到社會(huì)的廣泛青睞?!熬W(wǎng)絡(luò)化醫(yī)學(xué)儀器”作為本學(xué)科領(lǐng)域出現(xiàn)的新方向,在國(guó)內(nèi)外沒有現(xiàn)成的模式可以借鑒,為此我們提出了以下建設(shè)計(jì)劃。